在維斯巴尼亞王國，薩克拉女王死於獵槍走火事故，而王國的吉爾王子，因母親由於自己的獵槍走火死亡而過度自責，最後以手槍自殺身亡。慘劇的訊息迅速傳播，轟動各國新聞界，當然，也傳到了江戶川柯南和魯邦三世耳裡……女王及王子的死，使蜜拉公主將繼承王位成為下屆女王。當蜜拉女王到日本訪問時，她遇見和她十分相似的蘭。蜜拉希望自由地玩一次，而蘭想一嘗當公主的滋味，因此她們換了衣著，但基斯伯爵不公佈公主失蹤的訊息，並把蘭帶回國，而柯南亦偷偷地跟隨蘭上機……這個時候，魯邦準備向「女王皇冠」下手。慘劇背後隱藏著怎樣的祕密？「平成年代的福爾摩斯，日本警察的救世主」工藤新一（江戶川柯南）對決「世紀大盜」魯邦三世！勝利歸向何方？